先天性崎形的阴茎通常指阴茎在胚胎发育中形成的畸形，一殷说来是十分罕见的。
Ａ.阴茎缺如：阴茎发育障碍而缺如，但阴囊、睾丸发育正常，由于阴茎缺如，尿道常开口于会阴部、肛门或直肠内，因此排尿方向方向发生改变，当然就更不能进行性交活动。
Ｂ.潜伏阴茎：阴茎被阴囊、会阴部、耻骨部及大腿内侧皮下脂肪组织掩盖，而阴茎又短小，很易误诊为阴茎缺如症，但随着发育，皮下脂肪减少，阴茎可显露。潜伏阴茎多数合并泌尿系统畸形，需进行手术治疗。
Ｃ.阴囊后阴茎：阴茎位于阴囊后侧（肛门侧），多数合并泌尿系统畸形，需作手术治疗。
Ｄ.双阴茎：顾名思义是具有二只阴茎，双阴茎可有左右排列的，也有前后方向排列的，双阴茎有阴茎完整分成两个的，也有从阴茎根部分成两个的，也有从龟头分成两个的。双阴茎多数合并泌尿系统畸形，需作矫形手术。
Ｅ.先天性阴茎扭转症：阴茎在纵轴90～180度旋转或左右旋转，通常向左旋转占80％，向右旋转占20％，阴茎扭转易合并阴茎异常勃起，勃起不适或隐痛等症状。
Ｆ.先天性阴茎弯曲症：多数合并泌尿系统畸形，若不影响性交和排尿一般不作治疗，否则需作手术治疗。